Description
Contexte : Le Monkey Pox (Mpox) est une maladie zoonotique causée par le virus de la variole du singe (MPXV) qui est à l'origine d'une épidémie mondiale continue. En Afrique de l'Ouest, des études épidémiologiques et moléculaires ont révélé une circulation généralisée du MPXV avec une diversité génétique significative. La position du Togo dans le corridor épidémiologique ouest-africain et sa proximité avec des pays connaissant une circulation du Mpox constituent un risque. Le 16 mai 2025, le Togo a enregistré le premier cas.
L’objectif de cette étude est de décrire les caractéristiques moléculaires et génomiques des premiers cas de Mpox au Togo.
Méthodes : Il s’agit d’une étude transversale descriptive menée entre janvier et juin 2025 à l’Institut National d’Hygiène.
Les échantillons des liquides, des vésicules, des crottes et d’écouvillons oropharyngés de cas suspects de Mpox ont été obtenus dans le cadre de la riposte contre le Mpox. La détection a été réalisée par les techniques moléculaires (Genexpert/qPCR), et la détermination du clade par la PCR en temps réel (Kit LightMix® Modular Orthopox Virus Typing Assay,TIB MolBiol).
Les échantillons positifs (Ct inférieur à 30) ont été séquencés en utilisant le kit Illumina DNA prep with enrichment (Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit).
Résultats : Au 30 juin 2025, un total de 164 échantillons a été testé sur toute l’étendue du territoire. Quinze échantillons positifs sur 36 ont été séquencés, douze étaient de Clade IIb de lignée A.2.2.
Conclusion : Le Clade IIb de lignée A.2.2 est la souche qui circule actuellement au Togo. Il y a nécessité de renforcer les mesures de contrôle et de prévention des infections dans la communauté et dans les formations sanitaires.
| Section | Recherche originale |
|---|---|
| Mot-clé 1 | Mpox |
| Mot-clé 2 | Séquençage |
| Mot-clé 3 | Togo |
| Mot-clé 4 | 2025 |
